青蒿鳖甲汤最初就是叶天士用来治少阳疟的名方，温病学家吴鞠通著《温病条辨·卷三·下焦篇》中在叶天士方基础上去淡竹叶，规范用量，并冠以方名，作出方论：
夜热早凉，热退无汗，热自阴来者，青蒿鳖甲汤主之。
夜行阴分而热，日行阳分而凉，邪气深伏阴分可知;热退无汗，邪不出表而仍归阴分，更可知矣，故曰热自阴分而来，非上中焦之阳热也。邪气深伏阴分，混处气血之中，不能纯用养阴，又非壮火，更不得任用苦燥。故以鳖甲蠕动之物，入肝经至阴之分，既能养阴，又能入络搜邪;以青蒿芳香透络，从少阳领邪外出;细生地清阴络之热;丹皮泻血中之伏火;知母者，知病之母也，佐鳖甲、青蒿而成搜剔之功焉。
青蒿鳖甲汤方 (辛凉合甘寒法)青蒿 二钱 鳖甲 五钱 细生地 四钱 知母 二钱 丹皮 三钱 水五杯，煮取二杯，日再服。《温病条辨·卷三·下焦篇》
新冠疫情以来，已有不少中医用此方剂应用于新冠肺炎，也用于注射新冠疫苗后身体不适者。实用的剂量如下：
青蒿鳖甲汤：青蒿6克 鳖甲15克生地12克 知母6克 丹皮9克
水五杯，煮取二杯。
适用范围：注射新冠疫苗后不适者，用青蒿鳖甲汤。
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