心理障碍研究中，颠倒因果是很普遍的问题
除非是显著的病理性改变(例如帕金森病、阿尔茨海默病等)，一般情况下，大脑的变化都是心理障碍的结果而非原因，就好像长期不良的体态会导致肌肉失衡一样。如果不能解决不良的行为模式和发力习惯，肌力不平衡的问题就很难彻底解决。解决肌肉失衡最好的办法不是吃药，而是有针对性的强化和拉伸，以及系统性地体态矫正。心理治疗遵循的也应该是相同的思路。
长期的心理障碍必然会引起大脑的变化。对于大部分心理障碍，现代医学手段其实很难区分大脑发生的变化到底是病理性的还是生理性的，很难判断这些变化到底是心理障碍的原因还是结果。医学范式倾向于把大脑的变化看作心理障碍的原因，把药物干预看作核心治疗手段，这其中有一部分原因是出于医务工作者的私心。
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